Marguerite là một công chúa của Nhà của Bourgogne, một nhánh nhỏ của Triều đại Capet. Cô là con gái của Công tước Robert II xứ Bourgogne (1248–1306) và Agnes của Pháp (1260–1327), con gái nhỏ của Louis IX của Pháp và Marguerite xứ Provence.[1]

Năm 1305, Marguerite kết hôn với người anh họ của mình sau khi bị phế truất, Louis I, Vua Navarra, người lên ngôi vua Pháp vào tháng 11 năm 1314 Louis X của Pháp.[2] Họ chỉ có duy nhất một cô con gái rượu, sau này được lên làm nữ vương Navarra, Jeanne (1312-1349).

Đầu năm 1314, Marguerite bị cáo buộc bắt gặp trong một hành động ngoại tình trong Tour de Nesle Affair. Em họ của Marguerite, Isabelle của Pháp là một nhân chứng chống lại bà, Khiến cho Marguerite bị cầm tù trong 2 năm cuối đời, cùng với em dâu của mình Blanche xứ Bourgogne. Marguerite bị giam giữ tại Château Gaillard và qua đời sau khi bị một căn bệnh lao và không được điều trị.[3]